Вам, журналисты, с благодарностью от progenes

Когда меня выберут президентом Вселенной, я введу народный обычай — публичную порку журналистов на Главной Площади Вселенной. До тех пор, пока не перестанут врать и перекручивать. Буду бить и приговаривать: не ври! не перекручивай! не ври! не перекручивай! не ври! не перекручивай!

По поводу статьи про генетику вируса меня спрашивает вежливый один журналист, не могу ли я дать пару коментариев по поводу? А я могу, потому что я все еще глупая, наивная и грабли меня ничему не учат. Поэтому даю контакты и отвечаю. Кому интересно — можете взглянуть на вопросы и на ответы:

1. Насчет возможности антропогенного происхождения вируса — насколько это реально и возможно? Как вообще можно отличить "природный" вирус от искусственного?

По большому счету, с того момента, как человечество научилось выделять, культивировать и видоизменять вирусы, понятие "природный" и искусственный размылось. С другой стороны, вирус гриппа циркулирует в одомашненном и культивируемом человеком животном, поэтому получается, что человек уже создал для вируса особые "неестественные", курортные условия. Поэтому, косвенно мы вполне можем говорить об антропогенном происходжении вируса. Но говорить о намеренном злокачественном создании вируса можно только обладая богатым воображением.
Отличить "природный" вирус от искусственно созданного возможно только в одном случае. Если есть какие-либо данные о работе над этим конкретным штаммом в какой-либо лаборатории. Эту информацию очень сложно утаить. Коль скоро вирус можно выделить, геном  можно прочитать и сравнить с известными, то рано или поздно информация о том, как получился такой гибрид, появится.
Пока я вижу это скорее как "удачное" стечение обстоятельств.
 

2. Насколько по Вашему обоснована такая шумиха вокруг нового вируса и не может ли это быть связано с попыткой антикризисного перезапуска фармацевтического рынка? Есть мнение, что ВОЗ стоит больше заниматься СПИДом и туберкулезом от которых умирают больше чем от атипичных пневмоний и птичьего гриппа. Насколько это мнение имеет шанс на существование?

Идея антикризисного перезапуска фармацевтического рынка выглядит очень конспирологически. Понятно, что фармацевтические компании постараются воспользоваться паникой, возможно даже ее поддержать и получить свою прибыль. Однако у нас нет других фармацевтов, которые готовы работать над лекарствами исключительно из альтруистических убеждений, а лекарства и вакцина все-равно нужны. Надо хладнокровно оценивать риски, а они в данном случае есть.

Всегда найдется кто-то, кто скажет, что, наоборот, ВОЗу следует заниматься гриппом, а не туберкулезом и СПИДом. Однако, ВОЗ,  помимо гриппа, занимается и СПИДом, и туберкулезом по мере сил и ресурсов. Инфекционные болезни не только уносят жизни, они делают это с разной скоростью и эффективностью. Особенность этого штамма гриппа в необычно быстром распространении, а значит и вирулентности, а также и высокой летальности. Если упустить момент, то мы действительно можем столкнуться с пандемией.

3. Стоит ли опасаться "новой испанки", то есть пандемии сходной с последствиями "испанки" и как это можно избежать?
 

Думаю, что не стоит опасаться. Мы уже много чего знаем об этом вирусе. О способах его передачи и размножения,  его структуру и слабые места. Его распространение можно четко отслеживать. Есть действенные лекарства. Очень скоро будет вакцина. Существуют эффективные эпидемиологические мероприятия. Есть возможности быстрого информирования населения и коммуникация между врачами и учеными разных стран на высшем уровне. Одни карты распространения вируса в режиме реального времени вызывают восхищение. Я бы даже сказала, что человечество никогда ранее так не было готовым к встрече нового опасного заболевания. То есть в этом конкретном случае человечество может избежать пандемии, теперь бы научиться избегать паники.

Прочитали? А теперь внимание, вынос трупа
.http://www.trust.ua/news/1546.html

"вот итоговая статья. вернее уже после резки главредом.

надеюсь мы нигде сильно не ошиблись.
у меня начальник так все повернул

текст был на 15 тысч. и конспиралогия была только одной подтемой.

спасибо большое.

удачи вам."

Начальник. Так. Все. Повернул. Вот когда я стану президентом Вселенной…
Значит так, поскольку из всех контактов, которые у меня были со СМИ, удачно закончились только те, где я сама полностью писала статью, а случаи, когда я давала интервью или коментарии, все до одного закончились плачевно, поэтому выношу в заглавный пост — коментарии журналистам не даю никогда и ни при каких обстоятельствах.

Чисто похвастаться

Я между прочим работаю и пишу в ЖЖ в свободное от дачи и огорода время. Сейчас пора такая, закачаешься. Все хвастаются своими розочками и тюльпашками. А я что? Хуже?
В общем я только что из клумбы. Тут еще пару фото. Завидуйте!

Пару слов о генетике вируса гриппа.

Я пока прерву свои потуги касательно ГМО и напою о вирусе свиного гриппа, а то маразм в сети уже зашкаливает. Как раз ВОЗ в лице Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data(GISAID) открыло геномную последовательность злодейского вируса. Как мы видим, там как раз на сайте наплыв желающих посмотреть на вирус, не протолпиться, надо регистрироваться и то, только ученым. Но я вам расскажу сейчас, что это за монстр.

Итак, вирус гриппа (свиньи, лошадки, птицы, человека или курицы) это группка из восьми отдельных молекул РНК, суммарно порядка 13 тыщ нуклеотидов. Для сравнения, один порядочный ген содержит до 2 тыщ нуклеотидов, то есть генов в вирусе раз два и обчелся, а именно 11 (на некоторых отдельных молекулах РНК закодировано сразу два гена, поэтому). Каждый ген кодирует какой-то важный белок для конструкции вирусной капсулы или ферменты для раскодировки РНК.

1. Гемагглютинин HA
2. Нейраминидаза NA
3. Нуклеопротеин NP
4. Матриксовый белок М1
5. Матриксовый белок М2
6. Неструктурный белок NS1
7. Неструктурный белок NEP
8. РНК полимераза РА
9. РНК полимераза PB1
10. Запускатель клеточной смерти — апоптоза PB1-F2
11. И еще одна РНК полимераза PB2
Все.

Это все собирается в такую красивую гармоничную конструкцию

Эта вся бадья первым делом "синими" гемагглютининами цепляется к эпителиальным клеткам дыхательного пути, выпускает в клетку хозяина все свои восемь отдельных молекул РНК. На концах каждой молекулы есть хитрые последовательности, которые позволяют им сцепиться в хоровод, навесить на себя шапку (cap) и косить под классическую нормальную клеточную матричную РНК.
Клетка думает, что это что-то нужное и синтезирует белок как бы свой. Это с одной стороны. С другой стороны, РНК плывет в ядро, встраивается в геном и нарабатывает своей РНК побольше. Выплывает назад, собирается в чудовище, убивает клетку и идет гулять себе дальше. Итак, на каком-то этапе эти все 11 генов в составе 8ми молекул РНК плавают в клетке отдельно. Это важно.

Кроме того, что они там плавают, они еще и мутируют. Не мудрено, геном махонький, мутации подстерегают на каждом угду. Если мутация такая, что белок косой получается, вирус бесславно заканчивается свой путь в эволюции. Если мутации нейтральные или удачные, то они, соответственно фиксируются. Поболтался вирус в птицах, свиньях или людях сезон, глядишь, кое-какие нуклеотиды в генах поменялись. Ученые научились читать эти гены и в зависимости от мутаций называют вирусы H3N2, H1N1, H1N5 и так далее. Буковки в навании вируса для удобства и означают не что иное, как особенности мутации первых двух генов: гемагглютинина HA и нейраминидазы NA.

Если взять вирусы (как можно больше) с разных регионов мира в разное время, прочитать их и нанести на карту мира, можно прикинуть, где эти вирусы гуляли и который как мутировал. Это важно.

Теперь смотрим на гены нового свиного вируса H1N1. Оказалось, что ген гемагглютинина вроде обычный ничем не примечательный свиной американский ген, известный с 1999 года. Впрочем, остальные свиные американские вирусные гены — известный коктейль человеческого и птичьего вирусов. Однако гены нейраминидазы и матриксового белока М1 похожи на таковые из евразийских свиных вирусов, впервые зафиксированные в Таиланде. Я недаром отдельно отметила, что вирусная РНК способна какое-то время болтаться отдельно в клетке. Если теоретически один организм заразить миксом вирусов, то они там перепутываются и собираются заново с чужими РНКами (re-assorted). Свинья сама по себе подходящая биофабрика для подобных коктейлев, она, бедолага, восприимчива к человеческому, птичьему и к своему вирусу. В общем, как мы видим, комбинация получилась удачная.

Что касается вопроса о возможном искусственном получении подобного вируса, то тут вообще невозможно ничего толкового сказать. Я затрудняюсь сказать, насколько можно предугадать подобную эффективность нового монстра. Доктор Dr Frank Plummer, scientific director of the Winnipeg lab говорит:This is an interesting virus. It’s a brand new virus, not only to humans but to the world. How it did that, where it did it, when it did it, I don’t think we know yet.

UPD: Полезные ссылки от врачей
ОЧЕРЕДНОЙ СВИНОЙ ГРИПП: МИФЫ И РЕАЛИИ  от  

Все о гриппе от

uncle_doc

 ,  

ГМО. Часть 1. Вступление.

Как и обещала, по следам опроса решила начать цикл статей. Коллега velta-1 подсобила и написала свое видение ситуации Сагу о ГМО. Я постараюсь не отбирать у нее аудиторию, а дополнить то, что считаю нужным. При таком потоке дезинформации и заблуждений, лишней информации не бывает.

Принимаясь за этот масштабный проект, я не ставлю перед собой задачу пропагандировать ГМО, равно как и бороться с мракобесием. Я попытаюсь развеять ненужные волнения тех вменяемых людей, кто желает употреблять в пищу продукты без страхов и беспричинных тревог. Бояться стоит только того, чего действительно стоит бояться. В случае с ГМО этот тезис особенно актуален. Большинство страхов по поводу ГМО по своей природе иррациональны – люди боятся не того, чего бояться стоит. Реальные же проблемы и настоящие вопросы остаются без внимания, хотя именно они и требуют и ответов, и решений, потому как – будем смотреть правде в глаза – биотехнологии с каждым годом будут набирать обороты и количество ГМО будет неуклонно рости. В своих статтях я встану на сторону потребителя, чтобы искренне и с пониманием разобраться в путанном переплетении интуитивной осторожности и иррациональных страхов. В общем-то, вполне нормально, что люди волнуются за себя, за свое здоровье, за свое будущее, будущее своих детей, пусть даже не слишком разбираясь в теме.

Такая позиция представляется мне более здоровой, чем обреченное "уже ничего не изменить, все-равно все трансгенное: пшеница, томаты, яблоки…". Согласитесь, бояться и быть одновременно готовым употреблять продукты, считая все вокруг трансгенным, вредно для психического здоровья. Поэтому сразу спешу успокоить самых впечатлительных: на прилавках пока еще нет ни трансгенной пшеницы, ни томатов, ни яблок.

Как ученый, я привыкла принимать решения, располагая максимумом информации по тому или иному вопросу. При этому мне особенно важно, насколько такая информация достоверна, прозрачна, каково вообще ее качество. Статьи, которые я напишу на тему ГМО, адресованы в первую очередь тем, кто разделяет подобный подход. В этом смысле надпись на продуктовой этикетке "Не содержит ГМО" не отвечает ни одному из требований к информации: я не знаю, какого именно ГМО там нет, мне не понятно, кто и как проверял продукт на содержание ГМО, я до конца не понимаю, зачем вообще на этикетку нанесли эту информацию. С точки зрения разумного потребителя, сообщение "не содержит ГМО" можна смело считать нулевой информацией. Она не столько сообщает что-то, сколько манипулирует мною как покупателем.

Для всех, кому по-настоящему важен учет и контроль, есть хорошая новость: вся текущая информация касательно всех современных ГМО доступна как на глубоком профессиональном уровне, так и для потребителей, тщательно систематизирована и открыта для всех желающих ее получить. Всех, владеющих английским, отправляю на сайт GMO Compass. Тут собраны все мировые правовые документы, дискуссии, научные статьи, допуски, результаты анализов, кто, когда и каким образом делал те или другие ГМО, где они выращиваются, в каких объемах, на какой стадии допусков новые сорта, что уже сделано и что планируется сделать. Тут есть все – начиная с информации про то, какие ГМО уже есть на прилавках, и до лабораторных протоколов детекции. Все, что можно посчитать и учесть — посчитано и учтено, включая оценку черных рынков. Своей задачей вижу скорее раскрытие плюсов и минусов ГМО, оценки рисков и сравнение с уже существующими технологиями.

Журналистам на заметку.

Был такой известный трансплантолог Владимир Петрович Демихов, папа мировой трансплантологии. Так вот, он помимо пересадок легких, печени, сердца и коронарного шунтирования, придумал подключить к собаке вторую голову. Таком образом он вдохновил целую плеяду трансплантологов, в том числе американского нейротрансплантолога Роберта Уайта.
Роберт Уайт увлекся и уже в 70х годах пересадил голову обезьяне резус-макаке, используя технологию охлаждения могза. Голова могла следить глазами, кусать и, вероятно, что-то ощущать, однако тело оставалось парализованным, поскольку не удается восстановить связь спинного и головного мозга. Через несколько дней голова отторгалась имунной системой тела.

Уже сейчас надо вопросом восстановления связи спинного и головного мозга успешно работают и вроде бы решают с помощью стволовых клеток. А доктор Франкенштейн Уайт, которому уже больше 80ти лет не оставляет надежды пересадить человеческую голову. Для этого ему надо деньги, хороших хирургов, коррумпированных бюрократов и голов с телами. Это все он готов найти..

Сериал induced pluripotent stem (iPS) cells. Часть 5. Были iPS, стали РiPS

Когда года два назад я впервые писала о induced pluripotent stem (iPS) cells, я пророчески заметила, что надо ожидать больших прорывов. Еще не улеглись страсти по поводу предыдущего прорыва, как вчера анонсирован очередной технологический фокус.

Итак, в прошлой серии Марианна развелась с Хулио ученым удалось перепрограммировать стволовые клетки с помощью хитрых векторов, которые несут гены перепрограммирования, но не встраиваются в геном. После нескольких делений, вектора «терялись», клетки становились плюрипотентными и их можно использовать для дифференциации в какую-либо ткань. Все хорошо, но малоэффективно и работа очень тонкая и до практического применения еще далековато.

Как тут вчера анонсировали перепрограммирование нашептыванием вообще без использования ДНК и генетических манипуляций с клетками. Днями в Cell Stem Cell выйдет совместная публикация немецко-американского коллектива Hongyan Zhou, Shili Wu, Jin Young Joo, Saiyong Zhu, Dong Wook Han, Tongxiang Lin, Sunia Trauger, Geoffery Bien, Susan Yao, Yong Zhu, Gary Siuzdak, Hans R. Schöler, Lingxun Duan, Sheng Ding Generation of Induced Pluripotent Stem Cells Using Recombinant Proteins, а я вам напою, что о чем там будет

А знаете ли вы…

Что 14-17 апреля прошло пленарное заседание Общего собрания Национальной Академии Наук Украины, на котором планировались выборы Президента, вице-президента и нового состава президиума НАНУ. На пленарное заседание был также приглашен Президент Украины Виктор Ющенко.

Так вот. Уже три дня минуло с той поры, а в интернете и прессе НЕТ ОБ ЭТОМ НИ ОДНОГО УПОМИНАНИЯ, КАК НЕТ И РЕЗУЛЬТАТОВ ВЫБОРОВ РУКОВОДЯЩИХ ОРГАНОВ НАНУ.

С прошедшей Пасхой, вас, друзья.

UPD: на сайте НАНУ одно предложение, которое скромно сообщает, что президентом остался Борис Патон. Осенью прошлого года Борису Патону исполнилось 90 лет.

UPD2: пользуясь личными контактами, я узнала кто тепер вице-президент НАНУ и это не Владимир Литвин, а Гаец Валерий Михайлович.  Рейтинг научных публикаций новоизбранного вице-президента НАНУ, а также всех украинских академиков, можно посмотреть здесь (Гаец шестой снизу)

UPD3: А принял ли президент Ющенко приглашение на пленарное заседание НАНУ? Смотрим сайт президента:

Normal
0
21

false
false
false

MicrosoftInternetExplorer4

/* Style Definitions */
table.MsoNormalTable
{mso-style-name:»Normale Tabelle»;
mso-tstyle-rowband-size:0;
mso-tstyle-colband-size:0;
mso-style-noshow:yes;
mso-style-parent:»»;
mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;
mso-para-margin:0cm;
mso-para-margin-bottom:.0001pt;
mso-pagination:widow-orphan;
font-size:10.0pt;
font-family:»Times New Roman»;
mso-ansi-language:#0400;
mso-fareast-language:#0400;
mso-bidi-language:#0400;}

Віктор Ющенко відвідав Великоднє богослужіння в Свято-Успенській Києво-Печерській Лаврі
Президент відвідав Великоднє богослужіння в Андріївському соборі
Президент відвідав Великоднє богослужіння у храмі Василя Великого
Глава держави відвідав Великоднє богослужіння у Володимирському соборі
Президент України взяв участь у церемонії передачі Благодатного вогню
Президент привітав «Динамо» та «Шахтар» із виходом у півфінал Кубка УЄФА
Президент відвідав футбольний матч «Динамо» (Київ) — «Парі Сен-Жермен»
Президент провів нараду щодо будівництва храмів біля Тарасової гори
У Чистий четвер Президент взяв участь у богослужінні, що відбулося у Володимирському соборі

Все не то! Вот, нашла:

Normal
0
21

false
false
false

MicrosoftInternetExplorer4

/* Style Definitions */
table.MsoNormalTable
{mso-style-name:»Normale Tabelle»;
mso-tstyle-rowband-size:0;
mso-tstyle-colband-size:0;
mso-style-noshow:yes;
mso-style-parent:»»;
mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;
mso-para-margin:0cm;
mso-para-margin-bottom:.0001pt;
mso-pagination:widow-orphan;
font-size:10.0pt;
font-family:»Times New Roman»;
mso-ansi-language:#0400;
mso-fareast-language:#0400;
mso-bidi-language:#0400;}

Президент закликає українських науковців активніше залучитися до роботи з оцінки наслідків фінансово-економічної кризи в державі та вироблення механізмів її подолання

Ми маємо покінчити із нав’язаним і нав’язливим «хуторянством» у поглядах та принципом «моя хата з краю», — сказав Глава держави.

Normal
0
21

false
false
false

MicrosoftInternetExplorer4

/* Style Definitions */
table.MsoNormalTable
{mso-style-name:»Normale Tabelle»;
mso-tstyle-rowband-size:0;
mso-tstyle-colband-size:0;
mso-style-noshow:yes;
mso-style-parent:»»;
mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt;
mso-para-margin:0cm;
mso-para-margin-bottom:.0001pt;
mso-pagination:widow-orphan;
font-size:10.0pt;
font-family:»Times New Roman»;
mso-ansi-language:#0400;
mso-fareast-language:#0400;
mso-bidi-language:#0400;}

 

Требуется помощь зала.

Я и так знаю, что 780 читателей моей ЖЖешечки чудесно разбираются в науке и в биологии. Но надо помощь. Тут по следам недавнего обсуждения возникла идея написать эпическое полотно про ГМО. Я подумала, что было бы неплохо, если бы мы, лабораторные крысы, имели более широкое представление о страхах, мифах или предубеждениях касательно ГМО. То есть на данный момент я знаю как делают ГМО, для чего его делают, сколько его уже сделали, куда добавляют, и сколько еще вероятно будет. Все плюсы и минусы. Я также приблизительно знаю, что о нем пишут те, которые в предмете не разбирается. Меньше всего я знаю, как это все выглядит в головах простых потребителей. То есть меня тут регулярно спрашивают самые разные вопросы на эту тему, я по мере сил отвечаю.

Давайте, друзья, вы не поленитесь, пороетесь в голове и напишете все свои любые вопросы, подозрения, соображения, страхи, тревоги и личные мнения касательно ГМО сюда в коментарии. Самые наивные, простые, глупые или непрофессиональные. Мы потом сядем с коллегой, проанализируем и напишем обстоятельный ответ с убедительными примерами.

Заранее всем спасибо.

Вести с полей

Вчера в Германии министр сельского хозяйства Ильзе Айгнер наложила запрет на высаживание трансгенной кукурузы. В прессе наблюдается эффект разорвавшейся бомбы. Сейчас я попробую среди дыма и осколков разобраться и отделить зерна

Сериал induced pluripotent stem (iPS) cells. Часть 4.

Похоже, этот год особенно урожайный на технологические прорывы в теме induced pluripotent stem (iPS) cells. До сих пор наблюдалось стабильно одно открытие в год. В этом году уже два. Тем, кто пристально следит за темой, сейчас расскажу новость. Тем, кто не в курсе, предлагаю освежить информацию и кратко напою, что там случилось раньше.

Итак, за два последние года стало ясно, что для того, чтобы из дифференцированной клетки сделать стволовую, надо «включить» четыре гена. Эти гены можно встроить в клеточный геном с помощью генной инженерии, используя вирусные вектора. Попробовали — получается. Непонятно, что делать с этими встроенными генами — они никуда не деваются, продолжают работать, мешают. Потом разобрались, что достаточно двух генов, но клетки надо уже специальные брать. Хотя проблема встроенных генов осталась. Не прошло и пол-года, как научились эти два гена вырезать из генома обратно. Тоже хорошо, но неэффективно. И вот, в прошлом месяце новый прорыв.

С той самой лаборатории James Thomson, из которой в 2007 году вышла первая серия induced pluripotent stem (iPS) cells, вышла новая статья Human Induced Pluripotent Stem Cells Free of Vector and Transgene Sequences. На сей раз удалось придумать технологию, когда эти гены вообще не встраиваются в геном, а болтаются в цитоплазме и там работают. Уже давно наблюдалось, что при использовании молекулярных векторов на основе вируса Epstein-Barr, некоторые вектора «выбрасываются» из клетки. Это сначала рассматривалось как побочный нежелательный эффект, но его придумали использовать целенаправленно. В общем, теперь берут эти гены, временно «включают» в клетке, не встраивая в геном; клетки становятся стволовыми, а затем вектора «теряются».

Кстати, автор статьи Junying Yu, 1975 года рождения, китаянка. В 2007 году признана журналом Time одним из «людей 2007 года«.