Геном неандертальца

Кто еще не видел, спешите. В «Троицком варианте» статья Михаила Гельфанда (он же prahvessor) Геном другого человека.

Любопытная дискуссия на эту тему развернулась у ivanov-petrov.

ПРОморализаторство

На Edge свежий междусобойчик. На сей раз разговор про мораль. Докладчик — JOSHUA D. GREEENE — нейробиолог и философ, профессор из Гарварда. Скажу сразу, кому не лень, сразу читать или слушать туда (есть и доклад и расшифровка), а кому лень, читает то, что я

Интересные ссылки

Френдолента принесла прекрасный улов на тему языка и коммуникации у людей и животных.

via riftsh
О cтатье Леры Бородицкой, профессора Стэнфордского Университета в Wall Street Journal о том, как язык определяет сознание.

«если Джон нечаянно уронил вазу, по-английски скажут «Джон разбил вазу», а по-испански и по-японски «ваза разбилась». После просмотра видеозаписи, на которой посуду бьют и нарочно, и нечаянно, испанцы и японцы запоминают только тех, кто разбил нарочно, а американцы — и тех, и других.»

И еще про «слова» via lenka-iz-hij
О цикле статей на Элементах от wolf_kitses о коммуникации животных.

Когда животное что-то кричит или показывает другому животному — выполняет ли оно некую жесткую программу, автоматически выдавая исходящее В в ответ на входящее А, или пользуется этими звуками и жестами по собственному произволу, как люди словами?

Интересные ссылки

ya_solntse взяла интервью у Джеймса Уотсона, которое можно почитать Lente.ru

Кроме того Ирина Якутенко написала вольный пересказ лекции Джеймса Уотсона, которую он прочитал 15 июня на Биофаке МГУ и о чем можно прочитать также на Lente. ru.

Всем читать, а также писать ya_solntse в комментарии «Вот так молодец! Ну и ну! » Взять интервью в Уотсона это круто.

Про мозг и генетику.

Иногда наблюдаю скрытые интересные диалоги, которые разворачиваются во френдоленте, но при этом незаслуженно ускользают от внимания публики. Надо просто собрать их как паззл воедино, что я сейчас и сделаю.

Например, недавно в блоге ivanov_petrov обсуждалась лекция Татьяны Черниговской о языке и сознании. Помимо всего прочего, упомянуты генетические различия человека и шимпанзе. Не буду пересказывать, просто процитирую выдержки из лекции.

«…Споры о языке идут именно между сильными сторонами, у каждой из которых есть тонны аргументов. К чему сводится этот спор? В итоге он сводится к следующему. Есть все жители этой планеты, потом есть некий провал. И тогда начинается человек. Есть ли этот провал? Если он есть, значит люди действительно — вообще другие. Что это значит? Другие – это кто? В августе 2006-го года были опубликованы исследования, в рамках которых сравнивались геномы человека и шимпанзе. Те, кто этим занимались, пытались найти участки ДНК, в которых за 5 млн. лет произошли такие сильные изменения, которые отдалили нас от шимпанзе. Нашли несколько таких участков. В этих участках темпы изменения были существенно выше, чем в среднем по геному. Их оказалось 49. Я не генетик. Поэтому эту информацию комментировать научно я не возьмусь. Причем в некоторых участках изменения происходили в 70 раз быстрее, чем в среднем. Это огромная цифра. Почему такое ускорение произошло?

Тут есть множество спекуляций, правда, вне генетики. Хомский считает, что произошла макромутация, то есть взрыв, который привел к возникновению языка. Стивен Пинкер с некоторых пор занимает другую позицию. Общее у них в том, что есть модуль языка. Но Пинкер занимает более эволюционную позицию, говоря, что была серия микромутаций, которые привели к языку. Участки этих изменений разбросаны по всему геному. Встает вопрос: какие функции эти участки выполняют? Начали разбираться и выделили ген, который претерпел наиболее значительные изменения. Это небольшой ген, который называется HAR1, который входит в группу HAR1F, что означает Human accelerated region 1 forward. Он кодирует маленькую РНК. Но в нем содержится 118 различий между человеком и шимпанзе. Для сравнения: разница между шимпанзе и птицами – 2 различия. То есть был какой-то взрывной процесс. Это исследование было выполнено в Калифорнии целой группой людей. Этот HAR1F влияет на развитие нейронов новой коры между седьмой и девятнадцатой неделями развития плода. Это критичный период для миграции нейронов и специализации нейронов в коре. Это очень важно. И сразу было объявлено, что это ген мышления.»

Эту цитату лаконично прокомментировал galicarnax : Это как бы ошибка. Вся длина гена HAR1F — 118 нуклеотидов, из них между человеком и шимпанзе отличаются 18, а между шимпанзе и птицами — два.

А уже у себя дал развернутое и исключительно интересное сообщение об этой некодирующей РНК HAR1F .

Еще раз процитирую:
«Возможно, самым примечательным событием в геномике последних лет стало обнаружение некодирующих консервативных последовательностей — участков, которые не несут информацию о белках, но сохранаются в течение эволюции позвоночных не хуже (а порой и лучше), чем кодирующие экзоны. В геноме человека 1.5% нуклеотидов кодируют белки. Но доля консервативных участков составляет около 5%. Часть некодирующих 3.5% составляют зоны, регулирующие экспрессию генов, а также участки, с которых копируются функциональные молекулы РНК (прежде всего рРНК и тРНК) — они также похожи у всех организмов. Каковы функции оставшихся консервативных «записей», составляющих в сумме около 5 миллионов оснований — загадка. А функции у них, несомненно, есть, и крайне важные, судя по их сохранности. В среднем длина этих загадочных участков составляет 50-200 оснований.»

Для полноты картины у меня еще один кусочек паззла в рукаве про загадочные участки. Дискуссия у того же ivanov_petrov о темной материи генома. В даном случае речь идет пересмотре масштабов некодирующей, но транскрибирующейся части генома, которая непонятно, что делает. Согласно новым исследованиям их транскрибируется несколько меньше, чем ранее предполагалось, но тем не менее мы наблюдаем кучу непонятной считанной информации, смысл которой далеко еще непонятен. Но вот с HAR1F немножечко, совсем чуть-чуть, проблескивает хотя бы структура.

Блогомикроскоп. Выпуск #1

Меня как-то спросили, какие я блоги еще читаю не на русском, в идеале на английском, испанском или иврите, возможно это будет еще кому-то интересно. Испанским и ивритом не владею, увы, к тому же не знаю, насколько это будет интересно. Сейчас посмотрим.

Во-первых, я читаю немецкоязычный блог свободного астронома Флориана Фрайштеттера Astrodicticum simplex. Он живо пишет не только про астрономию и адронный коллайдер, но и походу пинает креационизм. Давеча подглядела у него перелинк на немецких космоблоггеров "Блог-телескоп". Это такой себе обзор блоговых космических событий. Например узнала про блог астрофизика Сюзанны Хофманн, которая в апреле возила немецких школьников по школам и университетам Новосибирска и Омска.
Россияне, вы вообще в курсе, что у вас дети ходят в планетарии и смотрят в телескоп на звезды? А студенты уже с первого курса моделируют самолеты, причем очень серьезно? В конце блоговой заметки взгляд немцев на быт россиян. С юмором описаны приключения с покупкой билетов, банковские перипетии и перелет из одного аэропорта Москвы в другой. Тоже в Москве.

Или например как вы отметили день космонавтики? А вот в Вене праздновали День Ночь Юрия. Да, Гагарина.

В общем, мне идея Блог-телескопа страшно понравилась. Я решила слямзить. Поскольку в небо я гляжу редко, а мой рабочий инструмент скорее микроскоп, то и выпуски я буду называть Блого-микроскопом. Хотите, смотрите под кат, а если неохота —

O нейрональных коррелятах веры

Самой расписывать некогда, да и статьи еще толком не прочитала. Вдруг кому будет интересно

1. The Neural Correlates of Religious and Nonreligious Belief

While religious and nonreligious thinking differentially engage broad regions of the frontal, parietal, and medial temporal lobes, the difference between belief and disbelief appears to be content-independent. Our study compares religious thinking with ordinary cognition and, as such, constitutes a step toward developing a neuropsychology of religion. However, these findings may also further our understanding of how the brain accepts statements of all kinds to be valid descriptions of the world.

2. И еще свежак:
Removing part of the brain can induce inner peace . The two parts of the brain that, when damaged, led to increases in spirituality: the left inferior parietal lobe and the right angular gyrus. These areas at the back of the brain are involved in how we perceive our bodies in spatial relation to the external world.

The Spiritual Brain: Selective Cortical Lesions Modulate Human Self-Transcendence

3. И еще одна ценная ссылочка, чтобы не потерялась, спешиал для
Academic Scientists at Work: I Can’t Believe They Didn’t Like It!

4. И еще одна: продолжения цикла о стволовых клетках от  

И еще раз о трехмерных изображениях.

Стараниями студентов Claessens laboratory из College of the Holy Cross, а также Гарвардского музея сравнительное зоологии, получилась интересная он-лайн коллекция трехмерных изображений птичьих костей 99 различных видов.

Кости посортированы по названиям костей, а также по научным именам птиц. Их можно разворачивать и зумить. Например, это череп вымершей птицы додо.

Кул!

Внимание ученым мозгам из Украины!

bis 31. März 2010 Bekanntmachung des Bundesministeriums für Bildung und Forschung (BMBF) im Rahmen der Strategie der Bundesregierung zur Internationalisierung von Wissenschaft und Forschung von Richtlinien zur Förderung der Wissenschaftlich-Technologischen Zusammenarbeit (WTZ) mit der Ukraine

http://www.internationales-buero.de/de/3699.php

Schwerpunkten (Упор на):

* Biotechnologien (биотехнологию);
* Technologien für die effektive Nutzung der Ressourcen und Energien, nachhaltige Umwelttechnologien (технологии эффективного использования ресурсов и энергий; технологии сохранения окружающей среды)
* Gesundheitsforschung und Medizintechnik (медицинские науки);
* Informations- und Kommunikationstechnologien (информационные и коммуникационные технологии);
* Nanotechnologien, neue Materialien und Produktionstechnologien (нанотехнологии, новые материалы и производственные технологии).
На два года по € 2.300 в месяц (страховки уже учтены)
Срочно подавать проекты у кого такие есть.

По многочисленным просьбам под катом

Полезные ссылки

Ну, допустим, я не пишу сейчас в блог ничего толкового, времени нет. Но зато другие пишут, есть что читать. Решила взять на себя добровольное обязательство рупора научно-популярных блоговых новостей.

1. Итак, случилось то, чего мы так долго ждали. terrink взялась за научно-популяризатоские посты. Замечательная тенденция.
И начала циклом «Стволовые клетки пуповинной крови, часть первая»
Что это такое? В каких случаях нужна бывает пересадка клеток пуповинной крови? Как происходит забор крови?

В анонсе:
Где хранят клетки пуповинной крови и кто за это платит?
Преимущества и недостатки частных и публичных банков пуповинной крови?
Каковы шансы, что кровь пригодится?

UPD: Я вот даже завидую в чем-то ЖЖистам. Вот где еще можно вот так напрямую без посредников получить грамотную информацию от специалиста, причем забесплатно? Задать ему вопросы, если чего не ясно. Вот вам еще о трансплантации пуповиной крови от jurgium.

2. Есть такая русскоязычная он-лайн газета «Троицкий вариант». Там пишут ученые популярно о науке для таких же ученых. То есть не совсем уже примитивно на пальцах, а вполне качественно и злободневно. Иногда пишут туда, а потом же сами у себя в ЖЖ ругаются друг на дружку. Такая славная газета.

Свежак. Сергей Попов, он же астроном, он же ЖЖ юзер sergepolar берет интервью у Михаила Вербицкого, которого в блогосфере представлять как-то даже и неудобно.

Для затравки цитата: Человечество само никакой ценности не представляет, помимо занятий наукой и искусствами.

Спасибо за внимание.