ПОЗДРАВЛЯЕМ!!!

С неуописуемым ощущение гордости сообщаю всем читателям ЖЖ, что у нашего дорогого и любимого френда shao_s буквально только что вышла статья в Science. Ура, товарищи!!! Молодец, shao_s! Так держать!

Защищено: Сенсация!!!

Это содержимое защищено паролем. Для его просмотра введите, пожалуйста, пароль:

Пароль:

Виртуальная бактерия.

Как-то в дискуссии о пользе-вреде ГМО промелькнул аргумент «вот ученые сами не знают точно, что там с генами происходит, когда вставить в геном чужеродный ген, вот пусть и не лезут своим грязными ручонками в святое». А действительно, что на самом деле ученые знают про геном и его работу? Ответ на этот вопрос призвано ответить отрасль современного направление молекулярной биологии, так называемой системной биологии, а именно транскриптомика. Всего несколько лет назад, на заре зарождения системной биологии, речь шла о необходимых компьютерных мощностях, которые способны обработать динамику работы десятков тысяч генов. Теперь уже можно сказать, что первые успешные шаги в этом направлении сделаны и в конце прошлого года появилась публикация в журнале Cell «A Predictive Model for Transcriptional Control of Physiology in a Free Living Cell«. Причем ключевое слово «predictiv», а значит модель, которая способна не только описать, но и предсказать поведение генома живой клетки при изменении условий. Прежде, чем мы углубимся в результаты работы, разберем, что такое

Про селекцию и не только.

Хотела уже закрыть тему про ГМО, как вспомнила, что забыла рассказать о прелестях традиционной мирной селекции. В самом деле, нафига нам страшные ГМО, у которых гены чужие, продукты которых могут вдруг оказаться аллегренными. Если при слове «селекционер» у вас встает перед взором такой себе добрый дедушка-селекционер с колоском в руках, среди бескрайних полей, то я сейчас вам это быстренько исправлю на хохочущего

демона.

Итак, сегодня, среди наиболее перспективных направлений в селекции (традиционной), рассматривается так называемый TILLING (Targeting Induced Local Lesions in Genomes) подход. Для этого берут организм, желательно с неплохо изученым геномом, и обрабатывают его EMS (Ethyl methanesulfonate). Это очень сильный мутаген, тератоген и карциноген. (Тут уже вполне можно выключить верхнее освещение и подсветить лицо фонариком снизу).

Если не очень переусердствовать с реагентом, то можно подобрать такую удачную концентрацию, когда еще не все потомство подохнет, а только 30%, а оставшиеся в живых будут иметь одну мутацию на каждые 170 000 нуклеотидов. Это очень много. Это фактически половина всех генов становятся уродами, а организмы едва теплят свое существование. Я не зря сказала про хорошо изученный геном, потому что TILLING позволяет нам из тысяч организмов найти того уродца, где изменен нужный нам ген. Конечно, помимо этого нужного нам гена там все поломано, но нас это пока не интересует. Ну например, корни там уродские, колосок кривой, листочки с пятачок, это все ерунда, главное, что у него содержание крахмала классное (или оно способно расти на песке без воды, или его не жрет никакой долгоносик)! А теперь мы его скрещиваем с нормальным хорошим живым организмом. Потомство тоже будет не очень ахти, но если каждый раз отбирать более-менее живенькое с этим самым хорошим содержанием крахмала (или другим приятным нам признаком) и дальше скрещивать, то уже за десяток поколений мы получим очень похожее на нормальное, но с нужным нам мутировавшим геном (благодаря молекулярно-биологическим подходам мы можем его физически отслеживать).

Или вот еще хороший метод для обхода трансгенности. Вот у нас рапс, да? А вот у нас арабидопсис, родственник, но с рапсом в природе не скрещивается. То есть скрещивается, но потомство не выживает. У арабидопсиса есть полезный ген, который мы могли бы без лишнего геморроя перенести в рапс. Но тогда на рапсе придется писать ГМО и волновать потребителя. Берем рапс и скрещиваем с арабидопсисом, а гибридный зародыш выращиваем в культуре инвитро методом «сохранения зародышей» (Пускает звуковым фоном что-то леденящее кровь и фонарик у подбородка меняет цвет на красный). То есть мы не один ген переносим, мы два генома разламываем и смешиваем. Один из сохраненных зародышей рапса будет иметь ген, который нам надо (плюс еще половина генов из арабидопсиса). Потомство от этого урода мы используем как донор для последующих скрещиваний. Уж сколько там в геноме наломается, словами не передать, но зато потребителю уже не страшно.  Это я не придумала, это уже так делают.

Вот если кто боится, что в результате трансгенности вдруг случайным образом получится какой-то аллергенный белочек (один), или вдруг какая устойчивость к долгоносикам, которая нашу экологию погубит, то оцените вероятность того же самого при таких монстрозных подходах. Но ничего, селекционеры делают реверанс в сторону ГМО паранойиков:»We have demonstrated the application of TILLING, a nontransgenic, reverse genetics technology, to generate a large amount of variation in the waxy loci of both allohexaploid and allotetraploid wheat, two species with genomes among the largest and most complex of flowering plants. By generating and identifying a large allelic series in three target genes, we were able to generate useful mutations in the waxy loci and to demonstrate the potential of TILLING for wheat crop improvement. «

Удивительное ближе, чем кажется.

Тут меня спросили про препарат Деринат. Иммуномодулятор, ага. От всего: ОРЗ, ОРВИ, риниты, гаймориты, фронтиты, синуситы, облитерирующие заболевания нижних конечностей, трофические язвы, гангрены, ожоги, обморожения, воспалительные заболевания слизистой полости рта, глаз, носа, влагалища, прямой кишки, геморрой. И от СПИДа. И от рака. Да. Можно закапывать в нос, в глаз, полоскать горло, в кишку клизмой, капельки в рот, поливать сверху, а можно и внутримышечно вколоть. Запатентован в Америке, если это имеет значение (но пусть вас это не смущает, авторы патента россияне).

И что же это за волшебное действующее вещество? А дезоксирибонуклеат натрия. А это, друззя, ДНК в чистом виде из молок осетровых. И пусть не вводит вас в заблуждение натрий. Это всего лишь для нейтрализации (ДНК это кислота, кто забыл), в растворе оно у нас диссоциирует. Ну и раствор у нас по солям физиологичным должен быть. А почему из молок осетровых, так это только по одной простой причине: материал бросовой и легкий для гомогенизации. Во факиры. Думаете дело в концентрации? (аж 2 грама). Так я вам скажу, что это эквивалентно пол-кило помидоров. Круто, ниче не скажеш. Приложил ДНК к больному месту и все. Пока весь мир пыхтит, ищет как бы поспецифичнее лекарство разработать.

В остальном мире эту натриевую соль ДНК тоже используют. Для понижения уровня неспицифической гибридизации в экспериментах по детекции нуклеиновых кислот. Там я понимаю для чего, сама использую. Но чтобы горло полоскать, это я до такого не додумалась. 

Пятиминутка зависти

Посмотрим правде в глаза: меня можно спокойно расфрендить, а зафрендить этого парня.

Про лекарства от депрессии.

Я долго думала, стоит ли писать об этом (почему, будет видно позже), но устоять не смогла. Больно интересная тема. Однако я думаю, что тем, кто страдает серьезными депрессиями и пробует лечиться медикаментозно, дальше

Еще пару слов про ГМО и тему можно закрыть.

В последнем номере «Зеркала недели» сразу две вменяемые статьи про ГМО и риски. Хвалю. «Обереги от предубеждений « и «Сон разума рождает чудовищ».

Теперь рассмотрим, что у нас на полях и на полках в супермаркете трансгенного.
Итак, если вы услышали, что кто-то говорит, что клубника, яблоки и томаты теперь стали невкусными, потому что видать трансгенные, можно смело рассмеяться в лицо. На рынке НЕТ трансгенных клубники, яблок и томатов. А также огурцов, баклажанов, капусты и лука. То есть ни один овощ или фрукт, который вы покупаете в супермаркете, НЕ трансгенный. «Неразмягчающиеся» томаты, которые в свое время пугали людей, далеких от генетики, были на рынке в США, но сплыли. По слухам в США бывают ГМО-цуккини, но в Европу они не поступают. То, что называют F1 семенной материал — это тоже НЕ трансген.

Тепер о тех ГМО, которые

Назад в природу.

Я смотрю, что пыль после чудесной статьи Каганова улеглась, однако есть в ней пару замечательных пассажей про полиплоидное уебище в виде огромной желтой елды селекцию кукурузы, о которой можно рассказывать долго и интересно. Тем более, что на днях появился симпатичный обзор о том, что мы знаем генах о одомашенных растений с красивыми картинками. Так что сегодня рассмотрим вариант "ген от кукурузы перенести в другую кукурузу, но нетрадиционным способом", а также посмотрим белкин хуй диких предшестенников культурных